Modelový rok 2003
Najväčšou novinkou je zavedenie nového motora Škoda 1.2 HTP (40 kW). Tento motor nahrádza doteraz ponúkané motory 1.0i (37 kW) a 1.4i (44 kW). Radový benzínový trojvalec objemu 1.2 l novej generácie vyhovuje emisnej norme EU4 a ponúka vysoký krútiaci moment už pri nízkych otáčkach. Pri priaznivej spotrebe 5,9 l/100km v kombinovanej prevádzke to znamená aj pokojný, tichý chod motora a plynulú pohodlnú jazdu. Zdvihový objem 1198 cm3 taktiež znamená aj nižsie sadzby poistného.

Attractive
Attractive vychádza z verzie Classic, ale už v základnej výbave ponúka okrem iného aj airbag vodiča a spolujazdca, palubný počítač, rádio Škoda MS 402 + 8 reproduktorov, centrálne zamykanie s diaľkovým ovládaním, elektrické ovládanie predných okien, malý kožený paket, výškovo nastaviteľné sedadlo vodiča a ďalšiu výbavu určenú pre vyššie verzie výbavy (Comfort, Elegance). Po prvý krát je u akčného modelu v štandardnej ponuke antiblokovací systém ABS. Exkluzívne pre Fabiu Attractive je ponúkaná farba modrá Admiral.
Attractive vo verzii hatchback môže byť vybavený novým koncernovým motorom 1,2 HTP (40 kW), ponuku pohonných jednotiek dopĺňa zážihový motor 1,4 MPI (50kW).
Ceny jednotlivých modelov
Škoda Fabia Attractive 1.2 HTP (40 kW) - 395.900 Sk
Škoda Fabia Attractive 1.4 MPI (50 kW) - 410.900 Sk
Škoda Fabia Combi Attractive 1.4 MPI (50 kW) - 440.900 Sk
Škoda Fabia Sedan Attractive 1.4 MPI (50 kW) - 433.900 Sk

Marathon
Pod označením Marathon uvádza ŠkodaAuto na slovenský trh ďalší akčný model v obľúbenej verzii Combi (v predaji od septembra 2002). Základná výbava a jazdné pohodlie vychádza z verzie Classic s množstvom komfortných prvkov, inak určených až pre vyššie stupne výbavy (Comfort, Elegance), ako napríklad airbag vodiča a spolujazdca, ABS, rádio MS 402 + 8 reproduktorov, výškovo nastaviteľné sedadlo vodiča, elektricky ovládané zrkadlá a predné okná, palubný počítač, delené zadné sedadlo. Interiéru dominujú čierne plasty a sedadlá v novej poťahovej látke Starship, určenej v sériovej výrobe od modelového roku 2003 pre verziu Comfort.
Marathon je ponúkaný so zážihovým motorom 1,4 MPI (50kW), vo farbách červená Corrida, čierna magická a strieborná diamantová, ktoré sú v cene vozidla.
Cena modelu
Škoda Fabia Combi Marathon 1.4 MPI (50 kW) - 429.500 Sk